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<p><span>这是一个良好的第一弹（初创），但还是一个游戏规则的改变者。看上去MINION似乎是在科学家们达成共识后,今天的第一次公开发布的数据产生的解释，它是由英国牛津纳米孔技术公司开发了一种先进的、高度可期待的DNA测序装置。</span></p><p><span>该公司的目标是使MINION成为用纳米孔技术的第一个商用序列，该技术已经发展了近二十年。该方法识别基于DNA 通过测量DNA片段通过生物孔径的变化它们的导电性产生的的变化。牛津纳米孔公司表示，其纳米孔的机器会比现有的测序技术更快更便宜，且将帮助科学家分析不能扩增的基因组区域 - 复制到多个相同的片段进行测试。</span></p><p><span>MinION尚未开始发售。但大卫谢斐，一个在马萨诸塞州的剑桥的Broad研究所计算生物学家，通过使用产生于设备的数据和牛津纳米孔提供的两种帮助细菌基因组的组装的数据，——那些<em>大肠杆菌</em>和细菌<em>Scardovia</em>（该属是在人类口腔中发现的）。今天在佛罗里马可岛的达州基因组生物学与技术会议他提出了他的成绩的进展。</span></p><p><span>“这是一种可爱的设备”MinION的谢斐说，这是貌似口一包香糖大小和形状。“它有漂亮的灯和愉快哼唱的风扇，并插入一个USB驱动器”，但他的技术审查喜忧参半。</span></p><p><span><strong>精炼读取</strong></span></p><p><span>在MinION所产生的序列的平均长度为5.4万个碱基，有些只要10个碱基。长于平均读出当前占主导地位的测序技术（由加利福尼亚州圣迭戈的Illumina公司出售的，它提供了DNA的数百个碱基对长的片段交付。但MinION的读取的中间的位数长度比牛津纳米孔在2012年宣布的目标短<strong>。</strong></span></p><p><span>谢菲也发现，MinION对于他研究的细菌基因组的特定部分似乎有测序困难。那是令人烦恼的生物信息，因为校正系统的测序错误比随机的错误更有挑战性。在谢斐的情况下，反复出现的错误阻止了他（从组装两个只使用MinION的数据的完整基因组序列细菌），相反，他用MinION序列来补充Illumina的机器生成的数据。</span></p><p><span>但关于MinION的未来他听起来持乐观态度。牛津纳米孔公司曾表示，更高质量的DNA或不同的制备方法应增加平均读长。贾菲说，公司可以努力消除错误，也许是通过使用各种孔隙具有不同的属性。但即使是现在，他说，最长时间的MinION读取绵延冗长，没有任何错误。系统误差是“我们希望他们会想出如何解决的暂时的功能”。</span></p><p><span><strong>初期</strong></span></p><p><span>其他研究者将很快有机会形成自己的观点有关设备，就像牛津纳米孔公司今天推出了其早期试用计划。支付1,000美元的研究人员，再加上250美元的运费，就可以在他们的实验室得到自己的MinION开始测试的机器。</span></p><p><span>但美国投资银行高盛分析师艾萨克RO—它在2012年建议Illumina公司，当它击退出价收购由瑞士制药巨头罗氏 - 叫谢斐的演讲“深刻印象”。“牛津纳米孔似乎仍然在开发模式，在我们看来是不太可能威胁[Illumina的]在这个时候竞争地位，”罗在一份研究报告中说。</span></p><p><span>然而，一些科学家认为，MinION有潜力撼动测序产业。在马萨诸塞州剑桥的怀特黑德生物医学研究所，遗传学家的Yaniv艾里说“对于科学家们用的笨重&昂贵的测序仪,小、价格便宜、便携的MinION是一个可喜的变化”。如果牛津纳米孔的不断改进技术，他说，它将使各种今天是不可能的应用范围扩展，如使用在实验室外音序器。</span></p><p><span>“这让我想起Illumina公司，初期的我，当读所有我们能找到有36个碱基对时，我们都非常激动”艾里说。“我认为我们应该给[牛津纳米孔]更多的时间。”</span></p><p><br /></p>
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发表于 2020-10-14 23:29:36